Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,预测 DNA 变异对特定细胞类型的影响
Google DeepMind 发布 AlphaGenome 2,通过条件模型预测 DNA 序列及其变异对特定细胞类型和状态的影响,并可分析未见过的细胞状态。模型使用超过 107 million 个单细胞图谱训练,在 TenK10K 数据集上的因果变异识别比例为 30%,对比原版经单细胞数据微调后的 16%,并新增 DNA 甲基化预测。
推荐理由:从组织平均值转向细胞类型与状态的条件预测,有助于定位被组织层面分析掩盖的变异效应,将遗传关联落到具体细胞。